มหาวิทยาลัยนเรศวร ได้ทำความร่วมมือทางวิชาการกับสำนักงานพัฒนาเทคโนโลยีอวกาศและภูมิสารสนเทศ (องค์การมหาชน) เพื่อให้บริการด้านการให้ความรู้ฝึกอบรมสัมนาพัฒนาหลักสูตรเพื่อการเรียนการสอน บริการข้อมูลการวิจัย และบริการด้านอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับเทคโนโลยีอวกาศและภูมิสารสนเทศ รวมถึงหน่วยงานต่างๆทั้งภาครัฐและเอกชน ในเขตพื้นที่ภาคเหนือตอนล่างและจังหวัดพะเยา จึงมีโครงการจัดตั้ง "ศูนย์ภูมิภาคเทคโนโลยีอวกาศและภูมิสารสนเทศภาคเหนือตอนล่าง" เมื่อวันที่ 30 ตุลาคม พ.ศ. 2544 โดยศูนย์แห่งนี้เป็น 1 ใน 5 ศูนย์ภูมิภาคทั่วประเทศไทย และสภามหาวิทยาลัยนเรศวรมีมติให้ศูนย์ฯ อยู่ภายใต้การดูแลของสำนักงานอธิการบดี ในคราวประชุมครั้งที่ 100 (1/2545) เมื่อวันที่ 9 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2545

ต่อมาในวันที่ 20 มิถุนายน พ.ศ. 2552 สภามหาวิทยาลัยนเรศวรได้มีมติให้เปลี่ยนชื่อใหม่เป็น "สถานภูมิภาคเทคโนโลยีอวกาศและภูมิสารสนเทศภาคเหนือตอนล่าง"[1]